杭州浙大迪迅生物基因工程有限公司

背景：表皮屏障蛋白-絲聚蛋白（FLG）的遺傳缺陷在濕疹和相關(guān)過敏性氣道疾病的病因中起著重要作用。然而，F(xiàn)LG中的功能缺失（LOF）突變是否會導(dǎo)致食物過敏的發(fā)生和持續(xù)仍存在爭議。

背景：特應(yīng)性皮炎（AD）與皮膚屏障調(diào)節(jié)失調(diào)有關(guān)，可能會誘發(fā)繼發(fā)性過敏性疾病，例如哮喘。此前有報道稱Tmem79ma/ma小鼠在編碼跨膜蛋白79（或Mattrin）的基因中存在一個與AD有關(guān)的突變。由于Tmem79基因突變，這些小鼠的皮膚屏障存在缺陷，并可發(fā)展為自發(fā)性皮膚炎癥。在這項研究中，評估了Tmem79ma/ma小鼠在自發(fā)性皮膚和肺部炎癥發(fā)展中的潛在免疫反應(yīng)。

①屋塵螨(HDM)是吸入性過敏原的主要來源，占全球過敏病例的50%以上，而屋塵螨過敏原的全譜尚不清楚。在這里，我們測序了一個高質(zhì)量的戶塵螨（Der p）基因組，以發(fā)現(xiàn)已知的典型過敏原和從粉塵螨在（Der f）基因組衍生出的過敏原同源物。②采用PacBio、Illumina和離子激流讀的混合組裝方法組裝了戶塵螨（Der p）基因組。用Cufflinks比較Der p和Der f 的轉(zhuǎn)錄組。采用二維凝膠電泳法和MALDI-ToF MS鑒定過敏原，通過ELISA法用病人血清與細(xì)菌表達(dá)的重組蛋白結(jié)合的方法檢測新過敏原的變應(yīng)原性。

藥物超敏反應(yīng)(DHRs)雖然發(fā)率較低，但可能會很嚴(yán)重，并導(dǎo)致終生后遺癥。診斷對于避免未來的過敏是至關(guān)重要的，并應(yīng)確定致敏的藥物和安全的替代品。然而，診斷是復(fù)雜和具有挑戰(zhàn)性的?？煽康捏w外試驗可提高DHR的診斷水平，并影響醫(yī)學(xué)決策。重要的是，體外測試通常不是作為一項單獨(dú)的測試而進(jìn)行的，而是作為診斷方法的一部分，或附加的測試。不同內(nèi)源性DHRs的體外治療方法有多種。

① IgG4相關(guān)疾病(IgG4-RD)是一種全身性疾病，其特點是血清IgG4濃度升高，多個病灶內(nèi)大量IgG4陽性漿細(xì)胞浸潤。已有報道IgG4-RD病變表現(xiàn)為Th2型細(xì)胞免疫。患者通常有過敏史和/或過敏癥狀。本研究旨在探討IgG4-RD患者的過敏反應(yīng)情況。②對富山大學(xué)附屬醫(yī)院就診的IgG4-RD患者進(jìn)行回顧性研究。根據(jù)綜合診斷標(biāo)準(zhǔn)對IgG4-RD進(jìn)行診斷。我們分析了鼻炎、支氣管哮喘的過敏病史、血清IgG4、IgE以及對16種氣傳過敏原的特異性IgE(CAP RAST)。

① 哮喘的遺傳學(xué)已經(jīng)廣泛地使用定量和分子遺傳學(xué)分析方法進(jìn)行研究，但是兩種方法都缺乏針對兒童表型和其他過敏性疾病特異性的研究；② 納入25306對9歲或12歲的瑞典雙胞胎；③ 對10075對雙胞胎的子集進(jìn)行16個單核苷酸多態(tài)性（SNP）的基因分型，這些單核苷酸多態(tài)性選自先前的GWAS；④ 兒童哮喘的遺傳力為0.82；⑤ IL1RL1中只有rs3771180與其他過敏性疾病相關(guān)（對于花粉熱）。

① 最近研究表明哮喘時氣道平滑肌細(xì)胞（ASMC）表型在增生和收縮之間的變化，強(qiáng)調(diào)了ASMC的可塑性在哮喘病理生理學(xué)中的作用；② 小鼠每周在屋塵螨提取物中暴露5次，共試驗5周；③ 給予H3K27去甲基化酶抑制劑(GSK-J4)可改善哮喘的經(jīng)典特征，如氣道高反應(yīng)性(AHR)、氣道炎癥和重塑；

MicroRNAs (miRNAs)可促進(jìn)細(xì)胞間通過胞外囊泡(EVs)進(jìn)行信息傳遞。EVs中miRNAs在過敏性氣道炎癥中的生物學(xué)作用尚不清楚。方法:從小鼠支氣管肺泡灌洗液(BALF)和屋塵螨(HDM)致敏小鼠中分離出呼吸道分泌性EVs (AEVs)。采用miRNA芯片對肺組織中AEVs、miRNA和mRNAs的表達(dá)情況進(jìn)行分析。

早期鼻腔微生物群的動態(tài)影響局部粘膜的免疫應(yīng)答和兒童呼吸道疾病的易感性。本病例對照研究的目的是監(jiān)測、評估和比較鼻炎和喘息嬰兒與健康對照組嬰兒在出生后18個月的鼻微生物群的構(gòu)成情況。在新加坡成長的122名研究對象中，在出生后的18個月里，縱向收集了超過7個時間點的前鼻拭子。

與兒童哮喘有關(guān)的DNA甲基化特征可能為疾病發(fā)病機(jī)制提供新的見解。我們做了一個表觀遺傳關(guān)聯(lián)研究來評估甲基化與兒童哮喘的關(guān)系。我們在過敏發(fā)生機(jī)理研究(MeDALL)項目中進(jìn)行了一項大規(guī)模的表觀基因組關(guān)聯(lián)研究(EWAS)。

在西方，過敏性疾病在上升，眾所周知的過敏保護(hù)與驅(qū)動因素如微生物和飲食暴露、污染和吸煙通過改變表觀遺傳景觀來介導(dǎo)它們的影響力。這里，我們回顧了過敏性疾病中參與的表觀遺傳學(xué)改變，總結(jié)和批判性地評估表觀遺傳學(xué)相關(guān)研究中經(jīng)驗教訓(xùn)。我們展示了表觀遺傳學(xué)在臨床中的各種應(yīng)用：作為診斷工具，評估免疫治療后的耐受或在早期可能性地預(yù)測治療的效果。另外，新的技術(shù)進(jìn)步如表觀基因組編輯一種脫氧核酶在將來可以對表觀基因組進(jìn)行目標(biāo)性的修飾并提供新的治療工具。

從“癥狀到分子” 的經(jīng)典過敏診斷包括：1）臨床病史，2）皮膚點刺試驗，3）最近的新方法：分子學(xué)過敏診斷。我們的目的是檢驗“從分子到癥狀”這個新的替換方法的診斷的精確性，這個方法在一個回顧性的研究中得到歐洲過敏與臨床免疫學(xué)會的推薦。

① 全基因組協(xié)會（GWA）的研究已經(jīng)明確與哮喘發(fā)生相關(guān)的基因，但是沒有研究哮喘緩解；② 臨床緩解（ClinR）的定義是，最近一年中沒有哮喘治療和喘息，最近3年內(nèi)無哮喘發(fā)作，完全緩解（ComR）在臨床緩解的條件基礎(chǔ)上，還必須保持正常肺功能和無支氣管高反應(yīng)性（BHR）；③ 評估了2個獨(dú)立群體(總n = 456)中25個頂端單核苷酸多態(tài)性(SNPs)的復(fù)制情況，然后對肺組織和上皮細(xì)胞中4個復(fù)制的SNP進(jìn)行定量位點表達(dá)(eQTL)分析；

① 先前有研究定義了成人哮喘的轉(zhuǎn)錄子亞型，然而這并不容易應(yīng)用于臨床，尤其是兒童哮喘；② 應(yīng)用Illumina芯片技術(shù)檢測133例哮喘患兒和11例健康對照的PBMC基因表達(dá)情況；③采用了2048個基因的k-means聚類算法將哮喘患兒分組；④ 84基因特征可以識別兒童重癥哮喘的白細(xì)胞，以及成人重癥哮喘的CD8+T細(xì)胞；⑤ PBMC和CD8+T細(xì)胞可作為重癥哮喘研究和鑒別的重要靶點